يتولي القسم تدريس مقررات هندسة الري والصرف، ميكانيكا الموائع، الهيدروليكا، تصميم المنشآت المائية ، الملاحة الداخلية وهندسة المواني، الهيدرولوجيا الهندسية، هندسة الموارد المائية وإدارة المياه، هندسة الأنفاق والسدود. الرسالة تتمثل مهمة برنامج هندسة المياه والمنشآت الهيدروليكية في تطوير الخبرة الفنية القادرة على فهم البيئة الفيزيائية المتعلقة بعلوم المياه وتطبيقها لتحقيق أهداف التنمية المستدامة ضمن الاستراتيجية المصرية. يهدف القسم إلى تخريج مهندسين مدنيين متعلمين ذوي خبرة خاصة في المشاريع الهندسية المتعلقة بالمياه والذين يمكنهم إثراء موارد المياه والأشغال العامة. كما تهدف الإدارة إلى إعداد خريجيها لفهم نظم المياه المتكاملة المستدامة والقضايا المتعلقة بالبيئة. هذا سيدعم تطوير المهندسين الموهوبين الذين يمكنهم مواجهة التحديات الحالية والمستقبلية في مصر والدول العربية وحوض نهر النيل. و يهدف البرنامج الي إعداد خريجين قادرين على: • المهارات المهنية والعملية لحل المشاكل الهندسية المدنية والمياه ذات الصلة مع الأخذ في الاعتبار البيئة المستدامة. • القدرة على تصميم ، بناء ، وحماية ، وتنفيذ الصيانة لجميع أنواع مشاريع البناء وخاصة المشاكل الهندسية المتعلقة بالمياه
