يلعب قسم الكيمياء الصيدلانية دوراً فعالاً في المجالين العملي والعلمي، حيث يتولى القسم تدريس مقررات الكيمياء العضوية الصيدلانية والكيمياء الصيدلانية وتصميم الأدوية لطلبة البكالوريوس، بالإضافة إلى مقررات الدراسات العليا لطلبة الماجستير والدكتوراه. كما ينظم القسم بشكل دوري ورش عمل عملية خاصة في مجال تصميم الأدوية بمساعدة الحاسوب CADD. كما يمتلك القسم مختبراً مبتكراً لتصميم الأدوية مزوداً بأجهزة كمبيوتر حديثة ومدعماً ببرامج متخصصة لتصميم الأدوية بهدف إجراء أبحاث فريدة من نوعها. وفيما يتعلق بالمرافق البحثية، يمتلك القسم 4 مختبرات بحثية، بالإضافة إلى مختبر الكيمياء الخضراء المزود بأدوات وأجهزة متطورة، بالإضافة إلى (مختبر الميكروويف) المصمم خصيصاً للتفاعلات الكيميائية المعقدة، والتي تكون خطرة أو تستغرق وقتاً طويلاً، مما يجعلها أكثر بساطة وأقل خطورة.