يقوم القسم بتدريس مقررات الميكروبيولوجيا العامة والمناعة والميكروبيولوجيا الصيدلانية والميكروبيولوجيا الطبية والتكنولوجيا الحيوية والصحة العامة والطفيليات ويشرف القسم على تدريس مقرر علم الأمراض بالإضافة إلى التعاون في مجال التدريس والبحث بين القسم وبعض كليات الصيدلة والطب في الجامعات الحكومية والخاصة على مستوى البكالوريوس والدراسات العليا ويهدف القسم إلى إرساء القواعد الأساسية للطالب في علم الميكروبيولوجيا والمناعة حيث يتلقى الطالب محاضرات ودروس عملية في أسس الميكروبيولوجيا والمناعة ويدرس الطالب مقرر الميكروبيولوجيا الصيدلانية والذي يتضمن طرق التعقيم بأنواعها وخصائصها وأهميتها ومضادات الميكروبات بأنواعها ومقاومتها الميكروبية وطرق تقييمها ثم ينتقل الطالب إلى دراسة مقرر الميكروبيولوجيا الطبية والذي يتناول دراسة أنواع الميكروبات المعدية والأمراض التي تسببها وطرق انتشارها والوقاية منها وعلاجها. يقوم القسم بتدريس مقرر التكنولوجيا الحيوية والذي يتناول أسس ومفاهيم التكنولوجيا الحيوية والهندسة الوراثية وتكنولوجيا التخمير والمنتجات التكنولوجية والمعالجات البيولوجية، ويتناول مقرر الصحة العامة دراسة مفاهيم علم الأوبئة والدراسات المتعلقة بعلم الأوبئة وكيفية السيطرة على الأمراض المعدية وغير المعدية لمنع انتشارها وتأثيراتها على الصحة العامة ودور التغذية والعوامل البيئية في ذلك، أما علم الطفيليات فيتناول الطفيليات وحيدة الخلية والديدان الممرضة للإنسان بأنواعها المختلفة (مفلطحة، أسطوانية، وغيرها) والأمراض الناتجة عن الإصابة بهذه الطفيليات وأعراضها وطرق انتشارها والحشرات التي تنقلها وأخرى ممرضة للإنسان وطرق السيطرة عليها، ويقدم القسم الاستشارات والخبرات في مجالات علم الأحياء الدقيقة العام والطبي والصيدلاني والصناعي. كما يقوم القسم بتقديم المساعدة الفنية اللازمة في مجال مراقبة وضمان الجودة فيما يتعلق بتقييم المضادات الحيوية والسلامة الميكروبيولوجية للمستحضرات الصيدلانية والتي تأتي من خارج الكلية أو من وحدة التجارب والأبحاث الصيدلانية المتقدمة بالكلية. ويقوم القسم بتطوير المقررات التي يدرسها بشكل مستمر بما يتماشى مع التطور السريع في مجال علم الأحياء الدقيقة. كما يقوم القسم بتنظيم بعض المشاريع البحثية التي يشارك فيها الطلبة بهدف إكسابهم الخبرة في مجال البحث العلمي.
