تم انشاء قسم العقاقیر- كلیة الصیدلة- جامعة المنصورة عام ١٩٧٠ م تحت الأشراف المباشر من قسم العقاقیر- كلیة الصیدلة- جامعة القاھرة وفي الوقت الحالي يعتبرقسم العقاقیر أكبر الأقسام العلميه في كليه الصيدله ويقوم بالتدريس للطلبه من المستوي الاول وحتي مرحلة البكالوريوس. يضم القسم عدد كبير من أعضاء هيئه التدريس ومعاونيهم. كما يضم القسم هيكلا إداريا مكونا من ثلاثه سكرتاريه بالإضافه الي اثتني عشره فنييا وتسعه عمال. يقع قسم العقاقير في المبني التعليمي (أ) في ثلاثه ادوار (الثالث والرابع والخامس) ويضم سته معامل للطلبه وسته معامل للابحاث بالإضافه الي معملين للدراسات البيولوجيه. يقوم القسم بتدريس مقررات تتضمن في إطارها طرق جمع العقاقير طبيعية المنشأ (نبات، حيوان، كائنات بحرية، كائنات دقيقة) وتخزينها وفصل مكوناتها والتعرف عليها وإعدادها للاستخدام في صياغة المستحضرات الصيدلية ودراسة طرق التحليل المختلفة والرقابة النوعية علي المستحضرات العشبية وكذلك أسس العلاج بالأعشاب كأحد طرق الطب التكميلي والبديل. كما يهتم القسم بتحسين فاعلية المركبات الطبيعية ذات الانشطة الحيوية من حيث الثباتية الكيميائية و الايضية و كذلك تقليل نسبة السمية و الاعراض الجانبية.
